大多數偏頭痛都找不到具體的原因，發生的機理也是眾說不一，有的認為與神經因素有關，有的認為與血管因素有關，有的則認為是神經血管因素共同作用的結果。本病也有一定的遺傳傾向，部分病人有家族史。儘管病因不是非常明確，但是偏頭痛常常會因為以下因素而誘發：熬夜、飲酒、濃茶、咖啡、過度勞累、感冒、顏面部和副鼻竇的炎症、生氣惱怒、焦慮、激動、過度飽餐等，都可以引起。不過，這些並不是真正的病因，而是誘因。任何原因只要能夠導致頭部顱內段血管痙攣、顱外段血管擴張，牽拉疼痛敏感結構，就會引起偏頭痛。