皰疹病毒性腦炎通常是急性單純皰疹病毒性腦炎。這種疾病的早期治療是降低死亡率的關鍵所在。臨床上主要使用阿昔洛韋抗病毒治療，也就是無環鳥苷，優先考慮靜脈注射治療，也可以考慮使用更昔洛韋靜脈注射治療。另外，還可以應用干擾素，轉移因子以及糖皮質激素進行免疫治療。此外積極的對症處理，支持治療，對重症患者也是至關重要的。