多系統萎縮多死於併發症，多系統萎縮本身並不一定會引起死亡。在多系統萎縮的最終，患者可以出現明顯的飲水嗆咳，吞嚥困難，此時就需要鼻飼飲食，保證進食，避免嗆咳。患者四肢動作遲緩，大部分就臥床。表現為四肢不能動，動作遲緩，不能行走，不能自己進食，穿衣等日常生活。需要家屬的護理，需要家屬每1~2小時給患者進行翻身拍背，患者可以出現發熱，咳嗽，痰不易咳出，聽診肺部明顯的乾溼性囉音，肺部感染嚴重，最終死於呼吸衰竭。