慢阻肺患者最終死於其併發症，慢性呼吸衰竭、慢性肺源性心臟病、慢性阻塞性肺疾病，這是呼吸科常見的持續氣流受阻、受限的疾病。如果慢阻肺控制不好可以出現嚴重的併發症，包括慢性呼吸衰竭、自發性氣胸、慢性肺源性心臟病、慢性呼吸衰竭，常在慢阻肺急性加重期時發生。
以上併發症呼吸困難症狀明顯加重，可以出現低氧血癥和高碳酸血癥，出現缺氧和二氧化碳瀦留的臨床表現。二氧化碳瀦留時嚴重的患者可以出現昏迷，臨床上稱為肺性腦病。患者的死亡率很高，可以出現自發性氣胸。這樣的患者會突然出現加重的呼吸困難，並伴有明顯的發紺。如果慢阻肺控制不好，可以出現慢性肺源性心臟病、肺動脈高壓、右心室肥厚擴大，最終發生右心功能不全。患者可以出現下肢浮腫，嚴重者可以出現腹壁水腫和胸腹水，患者死亡率也很高。所以，慢阻肺的患者需要積極的預防和治療，防止併發症的出現。