甲狀腺功能減退症事實上就是甲狀腺激素的一種缺乏，治療上就是補充甲狀腺激素。如果是甲狀腺激素完全缺乏，則應用甲狀腺激素的替代治療，用藥方面一般選擇左甲狀腺素鈉片，也就是優甲樂。
對於甲減這種疾病，完全可以實現臨床治癒，就是通過服用優甲樂治療，患者的甲狀腺功能可以完全正常。患者是否可以停藥，應根據患者的甲功來定，如果吃藥可以把甲功控制到正常範圍，則暫時不能停藥，但是有的患者病情會出現變化，也不能說甲減的患者完全需要終身服藥。