垂體瘤手術後的最常見後遺症就是垂體功能低下，主要是因為切除腫瘤以後對於垂體所造成的損傷所致，如果損傷垂體柄的話更容易導致。所以手術以後要進行常規的體內激素檢查，如果檢查有垂體功能低下，要按時的應用激素藥物維持。另外垂體瘤手術可以損傷到視神經和視交叉，手術後有可能出現視力下降，甚至失明的後遺症，在手術後可以用營養神經和消腫脫水藥物治療。