小兒腸套疊起病原因比較多，但是沒有一個具體原因可直接導致腸套疊的發生。臨床來講，比較常見的是嬰幼兒時期飲食、食物習慣的改變，譬如正在吃母乳，開始改為半流質或者吃粥、米糊這一類型食物時，因為食物性質改變，腸道消化功能會有一個適應過程，有些孩子可能出現消化功能紊亂，或者出現腸道蠕動增快，就會導致腸套疊的發生。還有腺病毒感染也會導致腸套疊的發生。平常熟悉的腸炎，細菌性痢疾等有時也會導致腸套疊的發生。年齡超過兩歲以上的孩子，可能會因為腸道息肉，或者梅克爾憩室，甚至腸道腫瘤等可以誘發腸套疊發生。腸套疊在臨床來講確實比較常見，臨床診斷跟治療方式均很成熟。所以儘管它對小孩來講是一個危害比較嚴重的疾病，但是目前治療手段都非常理想。