腸結核併發症較多，其中最嚴重的是腸梗阻和腸穿孔。腸結核是結核病中常見的一種類型，是結核分枝桿菌侵犯到患者腸道引起的腸道結核病。

腸結核最常見的併發症為腹水、淋巴結腫大以及腹腔積液，所有併發症中最嚴重的是腸梗阻以及腸穿孔。腸梗阻主要原因是腸道結核引起病灶，導致腸道狹窄、不通暢，引起腸道蠕動功能減退，腸腔內部排洩物不能順暢通過腸道，從而引起排洩物梗阻，造成腸道梗阻。腸穿孔會導致急性腹膜炎，甚至會危及患者生命。