扁平舌苔蘚是免疫相關的疾病，所以需要服用白芍總苷膠囊、羥氯喹、昆明山海棠、糖皮質激素等免疫調節劑，來治療糜爛性扁平舌苔蘚。對於沒有症狀的扁平舌苔蘚就只有白色花紋，不主張治療，避免吃生的姜蔥蒜、辣椒、醋等刺激性食物，並控制扁平舌苔蘚的症狀，避免糜爛。