大部分情況下皮脂腺囊腫需進行開刀治療，皮脂腺囊腫是常見疾病，由於毛囊阻塞，導致皮脂腺囊腫內有較多豆腐渣樣感染物質，具有包膜，通過擠壓或清創消毒方式，只能將其內的感染組織去除。如果不去除包膜，病情會反覆發作。

在麻醉狀態下可以將患者的皮脂腺囊腫完整切除，給予規律換藥。少數患者的皮脂腺囊腫生長於臉部，局部出現紅腫，可能不能進行手術，需進行規律換藥，使用專用的挖勺去除感染組織，有時能將囊皮去除，容易去除不淨，導致病情再次發作。患有皮脂腺囊腫後需儘早到醫院，找專科醫生進行處理，不能自行處理，防止病情加重。治療期間患者應避免飲用含有酒精的飲品，不能吃過於辛辣的食物，避免病情進一步加重。