中醫治療胃食管反流病的中藥通常是促動力藥物，比如枳實導滯丸、胃蘇顆粒、氣滯胃痛沖劑、胃逆康等，也包括楓蓼腸胃康等清熱化溼藥。保護胃黏膜的藥物，常使用康復新液來修復黏膜，部分病人會出現反酸、燒心，常用中藥的烏貝散、左金丸，可以獲得比較好的療效。

胃食管反流的病理機制一方面是胃動力差、食管動力差，導致酸無法往下清除而向上反流，另一方面是胃排空差、胃壓力過大。中醫治療胃食管反流病同時需要辨證治療與辨病治療，辨證治療要先判斷證型，看是肝氣鬱結、肝胃不和，還是溼熱阻滯、寒熱錯雜、肝胃鬱熱、脾胃虛寒、胃陰不足等，明確具體證型後再選擇不同的藥物治療。