胃食管反流病在臨床上主要表現為兩大類，一類是反流性食管炎，可以在胃鏡下看到食管下段糜爛，可以根據糜爛範圍進行分期。另外一類是食管下段和正常胃鏡檢查結果沒有差異，但患者會反覆表現出反酸，伴有燒心，嚴重時會出現胸痛，叫做胃鏡下陰性胃食管反流病。
反酸治療在臨床上非常規範，一般醫生會給患者用抑制胃酸分泌的PPI製劑，如奧美拉唑，加上促進食管蠕動的藥物，能夠減輕反酸，部分醫生會加用食管黏膜保護劑減輕反酸情況。