賁門癌晚期的患者在瀕臨死亡前幾天時，由於大量的消耗，通常會出現貧血、低蛋白血癥、水腫。由於腫瘤繼續侵犯，到達胃食管交界處的大血管，可能出現劇烈的嘔吐、大量的嘔血，甚至是黑便的情況；腫瘤轉移到區域淋巴結，壓迫神經出現重度的腹痛，影響睡眠或者無法入睡；腫瘤侵犯到腹腔其他器官，侵犯肝臟出現轉氨酶的升高、黃疸、腹水；腫瘤侵犯輸尿管，則可能出現排尿不暢；腫瘤轉移至肺部，出現呼吸困難、胸痛；腫瘤轉移至骨骼，會出現骨骼的劇烈疼痛；轉移到胸椎和腰椎，由於這些骨頭都是承重骨，全身的重量壓在這些椎體上，一旦腫瘤轉移到此處，造成椎體強度下降，可能出現壓縮性骨折，甚至是截癱。

在賁門癌晚期時，腫瘤的局部浸潤以及腫瘤的遠端轉移，都可能為患者帶來難以忍受的痛苦症狀。因此對於晚期賁門癌的患者，還是儘量要送到醫療機構接受支持治療，緩解臨終期的痛苦。