賁門癌在早期時，可能會出現上腹的隱痛不適持續加重，或持續不能緩解的症狀。中期可能會出現進食以後有頓挫感，停滯之後才能下行。晚期可能會出現噁心、嘔吐、嘔血、黑便，甚至出現劇烈腹痛的症狀。賁門所在的位置即食管和胃的銜接處，這一部分的管腔較食管更為狹窄，一旦出現腫瘤，使本來狹窄的管腔更加難以通行。

患者常先表現為上腹部的脹滿不適，隨後由於梗阻進一步加重，進食幹食或粗糙食物之後，則會感到食物停滯在上腹部，不能下行，一段時間以後會自行緩解。若症狀進一步加重，腫瘤造成完全性梗阻或局部破潰出血後，亦會出現噁心、嘔吐或嘔血、黑便。當腫瘤轉移到腹腔淋巴結，壓迫腹膜的神經之後，患者會感到腹部和背部劇烈的疼痛，而且由於壓迫神經叢，通常疼痛十分劇烈、難以忍受，需給予較強的止疼藥物進行緩解，如嗎啡類。