胃食管反流病在門診較多見，對於有典型反流或者燒心症狀的患者，醫生懷疑為胃食管反流病，需要進行胃鏡檢查。有的患者對胃鏡恐懼，不願意做胃鏡檢查，可以用抑制胃酸分泌藥物進行試驗性治療，觀察療效，如果患者症狀明顯緩解，可以初步診斷胃食管反流病。但是，建議患者進一步進行上消化道鋇餐造影檢查以及胃鏡檢查，以便進行確診。

如果胃鏡檢查時沒有明顯胃食管反流病的表現，但是又懷疑是胃食管反流病的患者，可以進行食管pH值檢測以及食管測壓，如果存在胃食管反流病表現，進行試驗性藥物治療後有效，也可以進行確診。

但是，如果患者有反酸、胸骨後不適表現，要先進行心電圖檢查，排除心肺疾病。胃食管反流病需與其它食管疾病進行鑑別，比如食管癌、消化性潰瘍、癔球症，這些疾病都可以引起反酸、胸骨後不適。