賁門癌手術費用並無統一標準，不同醫院、不同地區費用差別較大。消費水平較高或新技術應用較多區域，費用相對較高；消費水平較低或應用耗材較少區域，費用相對較低，如北京地區行賁門癌手術費用約6、7萬元，河南地區因賁門癌患者較多，手術治療時使用醫用耗材較少，主要靠手工縫合、吻合，手術費用相對偏低，相當於北京地區十年前費用，可能約數萬元。