若幼年型類天皰瘡的病情不嚴重且只侷限在某些位置，可考慮外用糖皮質激素藥膏，皮損面積較大則選擇激素類口服制劑，激素用量不宜過大且時間不宜過長，否則除常見不良反應外，還會影響幼兒生長發育，一旦病情被控制應及時選擇替代藥，並爭取在2年內治癒。藥物治療除環孢素損害較輕外，多數免疫抑制劑均不適合供兒童使用，另外非激素、非免疫抑制劑類藥物，如氨苯碸、柳氮磺吡啶，適用部分幼年型類天皰瘡，可在醫生指導下選用。