十二指腸類癌需要與十二指腸炎、十二指腸潰瘍以及十二指腸間質瘤、淋巴瘤、腺瘤或者息肉相鑑別，一般通過胃鏡或者十二指腸鏡檢查，根據不同的鏡下表現可以鑑別。若不易鑑別，可以通過超聲內鏡或者十二指腸鏡取病變組織進行病理檢查。

此外，十二指腸類癌可能會出現類癌綜合徵，比如陣發性顏面部潮紅、腹瀉、消瘦，部分患者可能會出現糖尿病的表現。