繼發性肝癌的治療效果比原發性肝癌差，與二者本身的機理有關。原發性肝癌主要為肝動脈供血，常見的繼發性肝癌為大腸癌轉移到肝臟，並非動脈供血，因此轉移性肝癌在動脈期血供不豐富，傳統肝動脈途徑的介入效果較差。

從病灶分佈上，轉移性肝癌、繼發性肝癌病灶一般分佈廣泛，有時左右肝都存在，做介入時難精準地進行選擇，效果也會打一定折扣。此外，繼發性肝癌有較多其他治療手段，如針對原發性腫瘤的全身藥物治療、放射治療以及目前新型出現的藥物治療，均可以取得較好效果。