對於兒童骨肉瘤的治療，特別強調要早期、規範和標準化，滿足以上要求，無論是截肢手術還是保肢手術，可以獲得較高的治癒率，能達到70%-80%。對於兒童惡性骨肉瘤，無論多積極治療，仍有40%會復發或疾病反覆，需要更高級別的治療。但由於腫瘤性質、細胞形態不同，骨肉瘤分類類型不同，治療複發率及治癒率也不同。

骨肉瘤分為較多種類型，有溶骨性、成骨性的骨肉瘤，成骨性骨肉瘤治療效果相比較好，而溶骨性的骨肉瘤，尤其是毛細血管擴張性骨肉瘤，惡性程度較高。如果復發，需要再次手術，或進行遠處轉移瘤病灶的切除，如肺轉移瘤切除。局部腫瘤復發後，還要再進行根治性切除，再進行手術以後的化療，通過綜合性治療，可以達到較好的治癒效果。雖然孩子存活超過3年或5年，也還需要進行定期複查和全面檢查，來評估腫瘤轉移和復發的情況。