兒童骨肉瘤進行保肢手術後，會面臨較多問題，生長受影響是其中的關鍵性問題。術後是否對肢體長度有影響，取決於兒童發病年齡，以及手術切除的骨段部位。如果骨的惡性腫瘤位於關節，尤其是四肢長骨幹的幹骺端，屬於生長發育區域，此處進行腫瘤根治性切除後，生長發育會受到影響。如果隨著後期對側肢體不斷增長後，手術區域肢體可能會出現短縮甚至畸形。

孩子是否要進行二期手術矯形，取決於後期短縮和畸形的程度。如果孩子就診時處於青春期，生長潛力已經處於較晚期，肢體長度差別沒有超過2-3cm，通過矯形鞋平衡，可以達到較好的生活質量，不需要進行手術。但是部分孩子發病時較小，尤其是5-8歲，此時生長潛力較大，還有較長的生長發育過程。如果日後預測雙下肢長短差距超過3cm，甚至可能達到嚴重的6-8cm，需要對同側肢體進行延長，或預計肢體長短為3-4cm，可以進行對側肢體阻滯，以平衡雙側肢體。