骨肉瘤常用的化療藥物包括阿黴素、順鉑、甲氨蝶呤、異環磷酰胺，多藥聯合化療比單藥效果更好，腫瘤細胞不易產生耐藥性。常用化療方案包括阿黴素和順鉑聯用化療方案、大劑量甲氨蝶呤聯合順鉑及阿黴素的方案。其中大劑量甲氨蝶呤危險性較大，需及時使用解毒藥四氫葉酸，否則可能出現致死性併發症。順鉑使用期間需輸入液體，加速藥物從體內排出，以防發生嚴重併發症。