鼻竇炎微創手術後通常會有後遺症。鼻竇炎是耳鼻喉科常見病，臨床多數鼻竇炎首選藥物保守治療。但部分患者有鼻腔結構異常或鼻息肉，或經治療以後症狀不緩解，需要進行手術治療。目前鼻竇炎手術基本是在鼻內鏡下進行的微創手術，手術較普及，安全性較高，但仍有併發症或後遺症的存在。

可能因手術水平或鼻竇病情較嚴重，導致術中損傷周圍結構如眶紙板，會引起眶內併發症，以及內直肌損傷、眶內感染等，可能會引起視力下降甚至失明。如果損傷顱底，可能導致顱內感染、腦脊液鼻漏等。因此鼻竇炎術後要按時複查，處理鼻腔的幹痂等分泌物，還有囊泡、肉芽等，如果處理不及時，可能導致鼻腔粘連，以及鼻竇炎術後復發。