用棉籤給嬰兒掏鼻孔不會引發嬰兒鼻炎，臨床上將鼻炎分為感染性鼻炎和非感染性鼻炎，非感染性鼻炎又可以分為過敏性鼻炎和非過敏性鼻炎，其中感染性鼻炎主要由呼吸道的細菌或病毒感染導致，而過敏性鼻炎則主要由於呼吸道過敏原所誘發。通過棉籤掏鼻孔時，可能對鼻腔的鼻腔黏膜造成刺激或損傷，從而導致嬰兒出現鼻腔黏膜的糜爛，甚至是小血管的破裂和出血，但通常不會誘發嬰兒出現鼻炎的表現。

除此之外，家長在用棉籤給嬰兒掏鼻孔時，儘量要選取比較細的棉籤，同時可以將棉籤沾上生理鹽水去清理嬰兒的鼻前庭，及前鼻孔部位的分泌物，可以減少棉籤對鼻腔黏膜的損傷。其中更好的方法是對前鼻孔噴生理海水來清理鼻腔，而不是用棉籤去掏。