飲用豆漿中毒的主要原因，是在飲用前沒有將豆漿燒熟煮透，生豆漿中含有胰蛋白酶抑制物和皂甙而引起中毒，預防豆漿中毒的根本方法就是把豆漿徹底煮開後再飲用。

當把豆漿加熱到一定溫度時豆漿開始出現泡沫，此時豆漿還未煮開，應適當減小火力繼續加熱至泡沫消失、豆漿沸騰，然後再持續加熱5-10分鐘豆漿就徹底煮熟了，飲用就不會發生中毒。若豆漿量較大或較稠，加熱時一定要不斷攪拌，使其受熱均勻防止燒糊鍋底。市場上銷售的豆粉出廠前已經過高溫加熱處理，飲用豆粉衝的豆漿不會中毒。