沙眼衣原體檢測陰性完全正常，但也要排除假陰性的可能，因此，兩次查衣原體為陰性，才可基本確定為陰性。沙眼衣原體屬於較常見病原體，臨床常見於非淋性尿道炎，治療時注意事項如下：

1、抗生素治療：使用頭孢類抗生素效果並不會特別好，所以需使用大環內酯類抗生素，比如阿奇黴素、克拉黴素、紅黴素、羅紅黴素等，效果可能更好。有條件者可做沙眼衣原體培養以及藥敏檢查，針對性選擇抗生素，達到更好的治療效果，並且治療療程應＞2周才可根除；

2、夫妻同治：可通過性傳播，若一方未轉陰，需戴安全套同房。