沙眼最初期感染後會有類似急性結膜炎的表現，之後可能會轉變進入慢性期。若沙眼未及時治療，會發展出較嚴重的併發症，主要表現有慢性沙眼引起的瞼結膜瘢痕、角膜血管翳、角膜混濁、角膜炎、瞼球粘連，甚至瞼內翻、倒睫等情況，這一系列併發症都是因慢性沙眼結膜炎長期未得到規範治療引起。

雖然沙眼本身症狀較輕，但嚴重的併發症可嚴重影響患者的視力，降低生活質量。所以沙眼應引起足夠重視，患者要進行規範治療，儘量減少併發症的發生。