引起先天斜視即先天性斜視的原因，通常有以下幾種：

1、眼外肌發育異常：可出現一條或多條肌肉變細或缺失，或肌肉生長位置有偏斜。此類因素可影響眼球運動，從而出現斜視；

2、眼神經發育異常：如有先天性動眼神經麻痺，由於此神經支配的肌肉缺乏力量，引起眼睛向下方和外下方斜視，同時出現上瞼下垂。發生錯位神經支配，眼球外轉時，眼睛內側肌肉應放鬆，但此時內轉肌肉收到錯誤收縮指令，出現眼球內外轉肌肉同時收縮，引起眼球后退綜合徵；

3、大腦功能異常：如早產兒因缺氧發生腦癱、先天腦部發育異常、腦積水等，斜視出現幾率可明顯增高；

4、遺傳因素：部分斜視可有家族遺傳史。

正常眼球運動需大腦發出指令，經顱神經傳導至眼球外側肌肉，後經多條肌肉協同才可實現。在此過程中，大腦、神經或肌肉某一處異常，均可能出現斜視。