通常飛秒激光治療散光的手術方式較安全，即產生副作用、危害的可能性較低，具有安全、高效性。飛秒激光分為全飛秒激光和半飛秒激光，半飛秒激光采用飛秒激光製作角膜瓣，通過準分子激光切削瓣下組織形成鏡片，主要危害是可能會發生術後乾眼、角膜瓣扭轉、角膜瓣下混濁、細菌感染引起瓣下感染，以及術後欠矯和過矯的可能性。

全飛秒激光手術是無瓣手術，克服半飛秒激光副作用，包括乾眼、感染髮生的可能性降低。但全飛秒激光手術角膜度數相差較高，視覺質量與激光手術相比較差。此外，患者發生術後眩光的可能性較大。但無論是全飛秒激光手術、半飛秒激光手術，均屬於安全、高效的手術方式，發生危害的可能性較低。