一般在醫院裡抽血檢查甲肝，主要通過血清學查甲肝抗體，臨床主要是查甲型肝炎IgM抗體。

如果是陽性，就證明患者近期可能感染甲型肝炎病毒，同時如果發現自身轉氨酶升高，又出現不想吃東西、厭油、乏力，或者噁心、嘔吐等消化道症狀，或者出現肝區疼、肝臟腫大，可能是患甲型病毒性肝炎。

甲型病毒性肝炎在患者血液裡還可以查IgG抗體，IgG抗體不能說明最近感染甲型肝炎，只能說明曾經感染過，可能更多用於流行病學調查。另外還可以查病人糞便，有時可能會在便中找到甲型肝炎病毒，也可以查病毒核酸。