甲肝病毒感染後多數患者無明顯臨床症狀，以隱性感染為主。部分患者表現為急性發病，以畏寒、發熱、腹痛、腹瀉、乏力、噁心、嘔吐、肝臟腫大為主要症狀，部分患者表現為肝功能升高，轉氨酶升高幅度達800-2000U/L不等，佔到整體患者的55%。急性發病人群中83%的患者出現發熱，體溫在38-39℃，病程多在三天之內，其中15%的人群發熱時間超過五天。部分患者以黃疸為表現，最初發病與感冒相似，常誤認為感冒而耽誤治療。