慢乙肝通常是指慢性乙型病毒性肝炎，干擾素治療慢性乙型病毒性肝炎，可以使乙肝病毒複製得到抑制，同時會刺激機體的免疫系統，使免疫細胞獲得長久對乙肝病毒的免疫控制。部分患者會隨著HBV-DNA的轉陰，以及e抗原的血清轉換，出現表面抗原陰轉，甚至發生表面抗原的血清學轉換，患者肝功能可以獲得持續的正常狀態，稱為慢性乙型病毒性肝炎的臨床治癒，但不能簡單認為是徹底治癒。

慢性乙型病毒性肝炎獲得臨床治癒後，患者的肝細胞核內仍然有微量的cccDNA，而cccDNA是與人體肝細胞核中的基因所整合到一起，一旦人體的免疫力下降，小量的cccDNA就會被激活，便會再次出現病毒複製，並造成肝臟損傷。因此慢性乙型病毒性肝炎經過應用干擾素後，獲得臨床治癒，是乙肝抗病毒治療可以獲得的最好效果，但並不能稱為是徹底治癒。

如果人體免疫力一直處於正常狀態，cccDNA便不會被激活，如果長期應用抗排異藥物、應用免疫抑制劑，或由於其他原因導致機體免疫力下降，cccDNA才有可能被激活。對於慢性乙型病毒性肝炎獲得臨床治癒的患者來說，依舊建議進行定期複查，同時在生活上要多加註意。如果由於其他原因需要應用免疫抑制劑，便應積極監測乙肝5項。