肺氣腫和肺囊腫沒法從疾病本身判斷哪個更嚴重，輕微的肺氣腫一定沒有較大的肺囊腫患者嚴重，因為較大的肺囊腫患者容易導致囊腫的反覆破裂從而形成氣胸，而如果肺氣腫比較嚴重，出現嚴重的通氣功能障礙到後期可以合併慢阻肺、肺心病、慢性呼吸衰竭等疾病，這時相比肺囊腫比較嚴重。

但無論是哪種疾病類型都要引起重視，對於肺氣腫的患者要儘早干預預防，對於較大的肺囊腫患者可以儘早在胸腔鏡下將囊腫切除。