耐藥性肺結核患者如果進行正規治療，大部分患者在2-3個月後痰塗片或痰培養表現為病原體已經清除，即痰塗片陰性。部分患者可能需要更長時間，如4-5個月才能轉陰，但只要轉陰都認為治療有效。

如果患者正規治療後，6個月內仍然不能轉陰，臨床醫生或患者需要高度重視。仔細分析治療方案是否合理，有無選擇足夠對耐藥肺結核有效的藥物進行治療，患者有無遵醫囑進行正規治療，以及患者除服藥外，有無進行足夠的生活調理。