單心室患者應在早期發現後儘早治療，以減輕痛苦，尤其是兒童將長期影響發育，症狀嚴重者可縮短壽命。如果不進行手術干預，患者即便輕微活動，也可導致呼吸困難，嚴重影響生活質量。對於成年女性，單心室無論是否已接受手術治療，均不建議懷孕。

單心室屬於較罕見先天性心臟，對患者影響較大，多數患者早期有明顯複雜先天性心臟病表現，如發紺、心動過速、體重緩慢增加與消瘦。長期發展可明顯發紺，出現心肌損傷，甚至導致充血性心力衰竭。對肺血增加患者，如果早期未發現則壽命較短，主要是由於充血性心衰、心律失常或猝死所致。