單心室是心腔通過兩個房室瓣口或共同房室瓣口同時接受兩個心房的血液，導致胎兒單心室的主要原因有：

胎兒單心室是屬於發育畸形，影響它的因素眾多，最關鍵的與三胚層的分化有關即是胚胎染色體出現異常;可能是免疫因素、遺傳因素和先天性因素的原因有關。

也可能與孕早期病毒感染有關和孕婦的身體狀況較差有關；還有可能與孕期不良的環境如輻射、羊水過多等有關。