單心室通常是由於胎兒發育異常引起，正常人心臟應該有左心室、右心室，心室間存在隔膜，稱為室間隔。單心室通常於胎兒或嬰幼兒中發現，屬於先天性心臟病。導致胎兒發育異常的常見原因如下：

1、染色體激變：導致染色體激變的常見原因有家族史、高齡產婦，以及產婦不良生活習慣，工作環境不當，例如存在放射線等，均可導致胎兒在最早的生長發育過程中出現問題，最終導致心臟結構明顯異常；

2、感染：例如病毒等引發宮內感染，導致胎兒在發育過程中，左心室、右心室的隔膜未形成。對胎兒的宮內發育，以及出生後的成長髮育影響巨大，且通常會導致嬰幼兒早夭。