心內膜墊缺損相對其它手術為較大型的心臟手術，手術時間、難度、風險及術後監護室停留時間、住院時間，都與一般心臟手術不同。在護理方面，具有獨特的特點，如最常見的心內膜墊缺損合併繼發性肺動脈高壓，此時對肺動脈壓力的觀測為護理的重要方面，可能需要綜合治療降低肺動脈壓力。

此外，在手術早期及監護室護理中，需要觀察患者的基礎狀態、傷口情況、生命體徵、血管活性藥物的使用情況及重要臟器的功能，如腎臟功能、心臟功能、呼吸道情況以及傷口創面的引流量等，出監護室轉入病房後，需主要關注患者的心臟康復、呼吸功能恢復等情況。