伽瑪刀治療垂體瘤的病人，因為相對手術或者其它治療方式來說，危害很小，相當於是安全無創而有效的治療方式。有些病人因為腫瘤壓迫，垂體瘤的病人本身有腫瘤把正常的垂體壓迫以後，正常的垂體功能一般都會受到損傷，所以垂體功能都不正常，再加上有些病人做了手術，手術創傷或者在做伽瑪刀以後，射線對正常垂體也有一定放射性損傷，造成患者垂體功能有一定下降。

所以病人的危害主要是造成垂體功能低下以後內分泌紊亂，但是這些病人可以通過內分泌治療，比如缺哪一種激素必須要用那個激素替代治療，效果還是很肯定的。另外更少見的危害是射線造成視神經、視通路受損，因為垂體的上方是視神經、視交叉，用伽瑪刀治療因為畢竟是射線，對於腫瘤細胞造成殺滅作用以後，對於正常神經也會有一定照射，所以有些患者在治療之後有可能會出現視神經受損，造成視力下降、視野缺損情況。