自身免疫性疾病是指機體對自身的抗原產生免疫反應而導致自身組織損害所引起的疾病。

　　人體有很大的免疫反應，當有一些外來細菌、病毒、寄生蟲、真菌等侵入人體時，會存在排斥和攻擊現象，這就是免疫現象。在一些特殊情況下，身體感染某些疾病或者是機體的免疫部隊存在缺陷時，對機體本身進行免疫反應，就會造成自身免疫性疾病，這種疾病以血中產生針對自身成分的抗體為特徵。比如Graves病、系統性紅斑狼瘡、類風溼關節炎等。

　　人體內分泌器官發生自身免疫應答也可以引起自身免疫性疾病。甲狀腺是最重要的內分泌器官之一，常見的自身免疫性甲狀腺疾病有Graves病、橋本甲狀腺炎、特發性甲狀腺功能減退等。

　　自身抗體的存在與自身免疫性疾病不是一樣的概念，自身抗體可存在沒有自身免疫性疾病的人群中，如甲狀腺上皮細胞、抗甲狀腺球蛋白、細胞核DNA抗體等。抗原受損或者發生變化可以激發自身抗體的產生。