引起小腦萎縮的原因比較多，主要原因如下：

1、遺傳因素：遺傳性脊髓小腦性共濟失調，由於基因變異引起，我國常見的遺傳性脊椎小腦性共濟失調致病基因是SCA3亞型的致病基因；

2、酗酒：長期酗酒會引起酒精性小腦變性，導致營養代謝障礙而出現小腦萎縮；

3、腦血管意外：會引起小腦出血或者梗塞，在治療後就會出現局部小腦萎縮；

4、頭部疾病：另外頭部的腫瘤、外傷等，也有可能會引起小腦局部萎縮。