腦萎縮沒有辦法逆轉，臨床中沒有發現特效藥物和治療方法，該病為一種難治性疾病。目前臨床治療主要是改善症狀，延緩病情進展程度。中醫辨證治療腦萎縮具有明顯優勢，發病後可配合針灸、推拿等治療。此外需控制血壓、血糖及採取抗血小板藥物，調脂藥物等預防腦血管疾病發生。

腦萎縮為阿爾茨海默病、帕金森病、多系統萎縮等疾病的共同基礎，老年痴呆到後期都會出現腦萎縮症狀。在治療過程中，一定需要給予患者社會心理支持，鼓勵患者參與社會活動，引導患者鍛鍊自身生活能力，能改善自身疾病狀態，對抑制疾病發展具有積極意義。