上、下運動神經元癱瘓主要靠臨床鑑別，下運動神經元癱瘓主要以症狀和電生理為主，上運動神經元癱瘓主要靠體徵，臨床醫生通過體格檢查發現，兩者不同。下運動神經元癱瘓主要症狀表現為肌無力、肌萎縮，肌肉早期出現明顯萎縮。另外，患者出現腱反射消失，並且沒有病理反射。通過電生理檢查可發現有些周圍神經，視神經改變，包括肌肉速顫等視神經改變，或是神經傳導出現異常。

上運動神經元癱瘓的症狀和下運動神經元類似，主要是肌無力，但沒有明顯萎縮或早期肌萎縮不明顯，當長期上運動神經元癱瘓後，到後期由於肢體長期不能運動，可能出現廢用性萎縮，但早期肌萎縮不明顯，主要靠體徵鑑別。上運動神經元癱瘓伴有明顯腱反射活躍或亢進，在臨床查體時可檢查出，包括膝腱反射，肱二頭肌、肱三頭肌反射等都可見到明顯反射活躍，還伴有明確病理反射存在，這就是上運動神經元癱瘓和下運動神經元癱瘓的鑑別。