中樞性眩暈主要是損壞小腦、前庭神經及腦幹的纖維導致的，病因可以見於：
1、血管炎性，比如小腦和腦幹的梗死、出血、短暫性腦缺血發作、鎖骨下動脈盜血綜合徵等；
2、腦幹和小腦腫瘤，比如聽神經瘤、腦膜瘤或膽脂瘤等；
3、腦幹或小腦感染，也可以出現眩暈，一般就是急性起病，伴有發熱等全身症狀；
4、累及腦幹和小腦的脫髓鞘疾病，比如多發性硬化；
5、顱頸交界處的畸形，比如Chiari畸形，顱底凹陷可合併眩暈；
6、一些藥物也可以導致中樞性眩暈，抗癲癇藥物比如卡馬西平、苯妥英鈉，長期使用就導致眩暈，有一些溶劑，比如甲醛也可以損壞小腦，出現眩暈，急性酒精中毒也可以損壞小腦，而出現中樞性眩暈；
7、外傷後出血，腦幹出血也可以引起眩暈；
8、中毒也可以引發中樞性眩暈；
9、前庭性偏頭痛是臨床常見的，具有遺傳傾向的，反覆發作的眩暈，還有噁心、頭痛為主要的臨床表現的一種疾病；
10、癲癇性眩暈也會出現眩暈症狀，但比較少見。