臨床上常用CT、核磁共振以及腦脊液檢查確定顱內囊蟲感染，其中陽性率最高的是核磁共振,通過腦脊液檢查直接確診則比較困難.如果是特殊寄生蟲感染，可以通過檢查相應的抗體或補體試驗；如果患者顱內囊蟲數量較少，應該首選核磁共振彌散加權成像觀察顱內是否存在蟲囊；如果數量較多或感染時間長，通過CT就可以觀察到相應的鈣化蟲灶。