腦囊蟲病治療要根據臨床表現，針對臨床的分期與患病部位的不同，其治療方法不同：1、腦內的腦囊蟲多采用服藥治療，也叫驅蟲治療，可服用治療囊蟲的藥，殺死囊蟲進行治療；2、腦室或腦池內的腦囊蟲，因囊蟲死亡造成炎症，出現粘連引發腦積水，則需通過手術進行治療。