隱球菌屬包括70餘個種和變種，絕大多數為新型隱球菌和格特隱球菌。隱球菌通常為條件性致病菌，大多為外源性感染，主要侵犯於免疫受損者，尤其是細胞免疫受損者，如艾滋病患者的感染率約為30%，常規服用免疫抑制劑的器官移植患者，發病率約為5%-10%，也常見於紅斑性狼瘡等免疫系統性疾病患者。經常熬夜或免疫功能低下的正常人群，可能也會受到感染，但幾率極小。