新型冠狀病毒肺炎患者最初的症狀，通常為上呼吸道感染的症狀或無症狀。當病毒進入鼻腔和咽腔後，穿破鼻腔、咽腔黏膜的細胞，進入細胞內繁殖，當病毒載量達到一定程度，就可以檢測為核酸陽性。患者在打噴嚏、咳嗽時，病毒會通過空氣傳染他人，大部分患者此時沒有任何症狀，個別患者會出現鼻塞、流涕、咽痛等輕微症狀，會誤認為是感冒，沒有采取任何措施。

隨著時間推移，鼻塞、流涕、打噴嚏、咽痛的症狀越來越重，甚至出現味覺、嗅覺喪失，此時會覺得進食沒有味道。而且患者出現發熱，體溫有低、有高，可以高達40℃，也可以不發熱，這些都是感染早期出現的上呼吸道感染症狀。

同時新型冠狀病毒會入侵患者的消化道，使患者產生厭食、乏力、噁心、嘔吐，甚至腹痛和腹瀉。當病毒載量逐漸增高，患者體溫會隨之增高，會出現雙肺感染，肺部會出現毛玻璃樣陰影，甚至實變陰影、斑片狀陰影及增生性陰影，這些陰影都是病毒在患者肺部複製的跡象。隨著病情進展，患者還可能會出現呼吸困難。