流感反覆發燒39℃，治療方法如下：

1、及時應用抗流感病毒藥物，如奧司他韋、帕拉米韋、阿比多爾等，儘快縮短病程；

2、臨時處理發熱，包括物理降溫與藥物降溫。物理降溫方法包括洗溫水澡或應用溫水擦拭大血管走行部位，如腋窩、腹股溝、頸部等。此外，發燒時需適當減少衣物，防止衣物過多不利於散熱，也可適當進食冷食。退燒藥物主要包括布洛芬與對乙酰氨基酚等。