流感特點為容易繼發細菌感染，尤其是肺炎鏈球菌感染。如果流感患者後期咳膿痰，通常提示患有細菌感染，主要治療如下：

1、應用針對抗肺炎鏈球菌藥物，如阿莫西林克拉維酸鉀或三代頭孢等，進行抗菌治療；

2、使用一些化痰類藥物，像氨溴索或乙酰半胱氨酸等，起到化痰目的。

對於流感後咳嗽，應用抗菌藥物進行病因治療較為關鍵。因流感於肺炎鏈球菌具有協同致死作用，後果較嚴重，需引起重視。